2020年7月2日，國際學術期刊Mucosal Immunology在線發(fā)表了中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所邱菊和秦駿研究組合作的題為“Brg1 restrains the pro-inflammatory properties of intestinal ILC3s and modulates intestinal inflammation”的最新研究成果。
3型天然淋巴細胞（group 3 innate lymphoid cells，ILC3s）作為固有免疫系統(tǒng)中的一個細胞類群，廣泛分布于腸道粘膜固有層中，在腸道炎癥過程中發(fā)揮重要的調控作用。天然淋巴細胞在分化早期以及待激活狀態(tài)下即實現(xiàn)了關鍵基因轉錄調控區(qū)域的染色質開放，這使其相比于功能相似的輔助性T細胞能夠更為快速地做出免疫應答。然而ILC3s如何通過染色質重組復合體實現(xiàn)對其細胞分化及功能進行調控尚未得到深入研究。
由Smarca4基因編碼的Brg1蛋白，作為SWI/SNF染色質重組復合體中唯一兩個含有ATP酶活性結構域的蛋白之一，在多種免疫細胞分化和功能中扮演重要角色。本研究首次通過Rorc-cre對ILC3s細胞中的Smarca4基因進行特異性敲除，以系統(tǒng)性地探究Brg1相關的SWI/SNF染色質重組復合體對ILC3s細胞的調控作用。研究發(fā)現(xiàn)Brg1缺失的ILC3s細胞存在NKp46+ILC3s細胞的明顯減少，并且隨著小鼠年齡增長過度增殖以致在腸道中大量積累，并在Rag1-/-背景下引起小鼠成年時期大腸自發(fā)炎癥，表現(xiàn)為腹瀉、脫肛和便血等癥狀，病理特征為腸道大量中性粒細胞浸潤和膿腫形成。進一步實驗證實：Brg1一方面在NKp46-ILC3s細胞中易化T-bet的表達（NKp46+ILC3s細胞分化的關鍵轉錄因子），從而促進其向NKp46+ILC3s細胞分化；另一方面Brg1在多種細胞因子刺激下抑制GM-CSF表達，上述現(xiàn)象在骨髓嵌合體小鼠體系中得到了內(nèi)因性論證。GM-CSF體內(nèi)抗體中和實驗有效緩解了Rag1-/-背景下敲除組小鼠的腸道炎癥，證明GM-CSF失去Brg1約束展現(xiàn)的致炎性功能是導致小鼠大腸自發(fā)炎癥的主要原因。最后，研究人員通過ATAC-seq和ChIP-qPCR實驗證明Brg1直接結合于T-bet和GM-CSF編碼基因Tbx21和Csf2的轉錄調控區(qū)域，通過改變?nèi)旧|結構和組蛋白修飾分別促進Tbx21和抑制Csf2基因的轉錄。
綜上所述，該研究發(fā)現(xiàn)了NKp46+ILC3s細胞分化早期階段Brg1相關的SWI/SNF染色質重組復合體在染色質結構為基因表達做出的準備工作，為ILC3s細胞亞型分化調控的相關研究提供了重要線索。此外，Brg1在表觀遺傳學水平上實現(xiàn)對ILC3s細胞增殖和致炎性功能的約束作用，其所在信號通路可能作為靶點實現(xiàn)對ILC3s有效干預，從而為炎癥性腸病等疑難疾病的治療提供新的方法，該信號通路仍有待于進一步研究。
該研究由上海交通大學醫(yī)學院博士研究生齊心一在邱菊研究員和秦駿研究員的指導下完成，并在中科院生物化學與細胞生物學研究所孫麗明研究員、中科院生物物理研究所柴謙研究員、美國Albany醫(yī)學院Yang Qi、德國海德堡大學Cui Guoliang、中科院上海營養(yǎng)與健康研究所生物信息技術平臺冀顏等的協(xié)助下共同完成。該研究得到了科技部、國家自然科學基金委、上海市科委、中國科學院先導項目的共同資助，以及上海交通大學醫(yī)學院博士創(chuàng)新基金項目的支持。該研究在上海營養(yǎng)與健康研究所公共技術平臺以及動物平臺的支持下完成。（科技處）
圖. Brg1促進NKp46+ILC3s的分化，并通過抑制ILC3表達GM-CSF從而抑制腸道炎癥。
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